MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 chromosome

Total Repeats: 155165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009664	CGG	2	6	1	6	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009664	CGC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009664	GAA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009664	ACT	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009664	GCACCT	2	12	280	291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152966184
6	NC_009664	CGA	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966184
7	NC_009664	TCG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
8	NC_009664	CGC	2	6	403	408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
9	NC_009664	TCACC	2	10	517	526	20 %	20 %	0 %	60 %	152966184
10	NC_009664	GAGC	2	8	539	546	25 %	0 %	50 %	25 %	152966184
11	NC_009664	TGG	2	6	552	557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966184
12	NC_009664	GCG	3	9	570	578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966184
13	NC_009664	CCA	2	6	582	587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966184
14	NC_009664	CGC	2	6	589	594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
15	NC_009664	CAC	3	9	595	603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966184
16	NC_009664	CTG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
17	NC_009664	CTC	2	6	697	702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966184
18	NC_009664	CTG	2	6	710	715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
19	NC_009664	CTG	2	6	728	733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
20	NC_009664	CCA	2	6	777	782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966184
21	NC_009664	GGC	2	6	796	801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966184
22	NC_009664	TGAG	2	8	828	835	25 %	25 %	50 %	0 %	152966184
23	NC_009664	CCGG	2	8	837	844	0 %	0 %	50 %	50 %	152966184
24	NC_009664	GCC	2	6	878	883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
25	NC_009664	CCG	2	6	999	1004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966184
26	NC_009664	CGG	3	9	1030	1038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966184
27	NC_009664	AGC	2	6	1065	1070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966184
28	NC_009664	TGC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966184
29	NC_009664	GCCGTG	5	30	1146	1175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009664	CGA	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009664	GTC	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009664	GCC	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009664	GCC	2	6	1248	1253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009664	CT	4	8	1307	1314	0 %	50 %	0 %	50 %	152966183
35	NC_009664	CCGG	2	8	1319	1326	0 %	0 %	50 %	50 %	152966183
36	NC_009664	CGC	2	6	1343	1348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966183
37	NC_009664	CG	3	6	1378	1383	0 %	0 %	50 %	50 %	152966183
38	NC_009664	CA	3	6	1415	1420	50 %	0 %	0 %	50 %	152966183
39	NC_009664	CAC	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966183
40	NC_009664	CAC	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966183
41	NC_009664	CGA	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966183
42	NC_009664	CTCA	2	8	1518	1525	25 %	25 %	0 %	50 %	152966183
43	NC_009664	ACG	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966183
44	NC_009664	CGT	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966183
45	NC_009664	TCA	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152966183
46	NC_009664	CTG	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009664	GCG	2	6	1688	1693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009664	CGG	3	9	1697	1705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009664	CGG	2	6	1708	1713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009664	CGG	2	6	1716	1721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009664	GCC	2	6	1733	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009664	GACCGC	2	12	1745	1756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009664	AGGC	2	8	1767	1774	25 %	0 %	50 %	25 %	152966182
54	NC_009664	CGA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
55	NC_009664	GCA	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
56	NC_009664	GGCC	2	8	1812	1819	0 %	0 %	50 %	50 %	152966182
57	NC_009664	GCC	2	6	1858	1863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
58	NC_009664	GAC	2	6	1873	1878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
59	NC_009664	GCG	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
60	NC_009664	GGT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966182
61	NC_009664	AGC	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
62	NC_009664	AGG	2	6	2024	2029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966182
63	NC_009664	GTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966182
64	NC_009664	TCGA	2	8	2051	2058	25 %	25 %	25 %	25 %	152966182
65	NC_009664	GTC	2	6	2088	2093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966182
66	NC_009664	GC	3	6	2105	2110	0 %	0 %	50 %	50 %	152966182
67	NC_009664	GCC	3	9	2147	2155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
68	NC_009664	CGG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
69	NC_009664	AGGT	2	8	2297	2304	25 %	25 %	50 %	0 %	152966182
70	NC_009664	CAG	2	6	2332	2337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
71	NC_009664	CGG	2	6	2385	2390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
72	NC_009664	CCG	2	6	2391	2396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
73	NC_009664	GC	3	6	2402	2407	0 %	0 %	50 %	50 %	152966182
74	NC_009664	CAG	2	6	2437	2442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966182
75	NC_009664	CGG	2	6	2448	2453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966182
76	NC_009664	TGG	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966182
77	NC_009664	CCG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966182
78	NC_009664	GTTC	2	8	2501	2508	0 %	50 %	25 %	25 %	152966182
79	NC_009664	TCGC	2	8	2513	2520	0 %	25 %	25 %	50 %	152966182
80	NC_009664	TTGACA	2	12	2547	2558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152966182
81	NC_009664	CGT	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009664	GAA	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009664	CGG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009664	GAC	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009664	CGA	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009664	ACGC	2	8	2807	2814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009664	CGG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009664	GCTC	2	8	2990	2997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009664	GGC	2	6	3024	3029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009664	CG	3	6	3032	3037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009664	CAC	2	6	3060	3065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009664	GCC	2	6	3067	3072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009664	CAC	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009664	AGG	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009664	CTC	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966181
96	NC_009664	CGCA	2	8	3275	3282	25 %	0 %	25 %	50 %	152966181
97	NC_009664	CGT	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
98	NC_009664	CCG	2	6	3313	3318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966181
99	NC_009664	GGT	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966181
100	NC_009664	TGA	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152966181
101	NC_009664	CGT	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
102	NC_009664	GC	3	6	3448	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	152966181
103	NC_009664	ACC	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966181
104	NC_009664	GTC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
105	NC_009664	GGC	2	6	3495	3500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966181
106	NC_009664	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966181
107	NC_009664	TCG	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
108	NC_009664	GC	3	6	3626	3631	0 %	0 %	50 %	50 %	152966181
109	NC_009664	CGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
110	NC_009664	CGT	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
111	NC_009664	TCG	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966181
112	NC_009664	GGCA	2	8	3756	3763	25 %	0 %	50 %	25 %	152966181
113	NC_009664	CGA	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
114	NC_009664	CGA	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
115	NC_009664	GCC	2	6	3904	3909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966181
116	NC_009664	GGA	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966181
117	NC_009664	CCT	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966181
118	NC_009664	CAG	2	6	3984	3989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966181
119	NC_009664	CG	3	6	4004	4009	0 %	0 %	50 %	50 %	152966181
120	NC_009664	CTC	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966181
121	NC_009664	GAG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966181
122	NC_009664	TTC	2	6	4110	4115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152966180
123	NC_009664	AGCAC	2	10	4140	4149	40 %	0 %	20 %	40 %	152966180
124	NC_009664	GGT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966180
125	NC_009664	GCC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966180
126	NC_009664	GCCG	2	8	4237	4244	0 %	0 %	50 %	50 %	152966180
127	NC_009664	CGGT	2	8	4245	4252	0 %	25 %	50 %	25 %	152966180
128	NC_009664	GCA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966180
129	NC_009664	AGG	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966180
130	NC_009664	CAG	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966180
131	NC_009664	GGT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966180
132	NC_009664	CAG	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966180
133	NC_009664	GCCC	2	8	4421	4428	0 %	0 %	25 %	75 %	152966180
134	NC_009664	CACTGA	2	12	4435	4446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152966180
135	NC_009664	GGC	2	6	4448	4453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966180
136	NC_009664	GGC	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966180
137	NC_009664	GGT	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152966180
138	NC_009664	TGC	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966180
139	NC_009664	ACC	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966180
140	NC_009664	TCATCC	2	12	4534	4545	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152966180
141	NC_009664	T	6	6	4555	4560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009664	GCCGT	2	10	4622	4631	0 %	20 %	40 %	40 %	152966179
143	NC_009664	GCC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966179
144	NC_009664	CTG	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966179
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147	NC_009664	CGG	2	6	4893	4898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966179
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149	NC_009664	GGCG	2	8	4959	4966	0 %	0 %	75 %	25 %	152966179
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158	NC_009664	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966179
159	NC_009664	GGCG	3	12	5337	5348	0 %	0 %	75 %	25 %	152966179
160	NC_009664	CGCT	2	8	5363	5370	0 %	25 %	25 %	50 %	152966179
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168	NC_009664	CCT	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_009664	AGGC	2	8	5702	5709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_009664	CCG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966178
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188	NC_009664	CGA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_009664	CG	3	6	6553	6558	0 %	0 %	50 %	50 %	152966177
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215	NC_009664	CGT	2	6	7695	7700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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217	NC_009664	GCGG	2	8	7788	7795	0 %	0 %	75 %	25 %	152966175
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221	NC_009664	ACC	2	6	7949	7954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966175
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253	NC_009664	ACG	2	6	8997	9002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152966174
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255	NC_009664	GCCC	2	8	9049	9056	0 %	0 %	25 %	75 %	152966174
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257	NC_009664	GTC	2	6	9095	9100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966174
258	NC_009664	CCA	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_009664	CGG	2	6	9195	9200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_009664	CGT	2	6	9257	9262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009664	CGCAGC	2	12	9274	9285	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
262	NC_009664	CGA	3	9	9296	9304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_009664	GCA	2	6	9332	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_009664	G	6	6	9361	9366	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009664	TCG	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_009664	GCCCA	4	20	9417	9436	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
267	NC_009664	CGA	2	6	9457	9462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_009664	GAG	2	6	9465	9470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_009664	GGTG	2	8	9539	9546	0 %	25 %	75 %	0 %	152966173
270	NC_009664	CTG	2	6	9573	9578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152966173
271	NC_009664	CAC	2	6	9579	9584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152966173
272	NC_009664	TCA	2	6	9610	9615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152966173
273	NC_009664	GAT	2	6	9620	9625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152966173
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278	NC_009664	CGCC	2	8	9731	9738	0 %	0 %	25 %	75 %	152966173
279	NC_009664	CGG	2	6	9785	9790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152966173
280	NC_009664	GATGT	2	10	9798	9807	20 %	40 %	40 %	0 %	152966173
281	NC_009664	CGC	2	6	9822	9827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152966173
282	NC_009664	GAG	2	6	9849	9854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966173
283	NC_009664	CG	3	6	9859	9864	0 %	0 %	50 %	50 %	152966173
284	NC_009664	GAG	3	9	9910	9918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152966173
285	NC_009664	GCC	2	6	9940	9945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_009664	GC	3	6	9990	9995	0 %	0 %	50 %	50 %	152966172
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292	NC_009664	CG	3	6	10276	10281	0 %	0 %	50 %	50 %	152966172
293	NC_009664	CCCA	2	8	10340	10347	25 %	0 %	0 %	75 %	152966172
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296	NC_009664	CCT	2	6	10408	10413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152966172
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303	NC_009664	GGGCGT	2	12	10662	10673	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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370	NC_009664	CCACC	2	10	13003	13012	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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396	NC_009664	TCCCCG	2	12	13820	13831	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	152966169
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399	NC_009664	GCC	2	6	14032	14037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
400	NC_009664	GCC	2	6	14045	14050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
401	NC_009664	CCCGGC	2	12	14070	14081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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